Ny "eDNA" -metode for å overvåke britisk akvatisk mangfold

Edna Mode's Great Quotes - The Incredibles (April 2019).

Anonim

En ny metode for DNA analyse for å overvåke mangfoldet av britiske farvann, som kan bidra til å bevare truede arter, har vært pioner av forskere fra UEA.

NatureMetrics, et spin-out selskap fra UEA, har annonsert lanseringen av nyskapende "miljø-DNA" eller "eDNA" fisk overvåkning, som identifiserer hele samfunn av fisk fra dammer, innsjøer, bekker, elver, elvemunning og hav.

Tradisjonelt, for å undersøke vannveier, ville forskere trenge å fange dyrene selv. Med denne nye teknikken kan DNA-amplifikasjon og sekvensering brukes til å identifisere hvilke dyr som har vært tilstede i et område av vann, alt i en test.

Metoden, kunne vurdere virkningen av vannkraftverk og andre barrierer på passasjen av trekkfisk, inkludert truede arter som ål. Ankomst og spredning av invasive arter, som kan true innfødte arter, kan også overvåkes.

Trodde å være den første kommersielle tjenesten av sitt slag i Storbritannia, er teknikkene billigere og mindre invasive enn tradisjonelle metoder for oppmåling av fisk, for eksempel garnering eller elektrofiske, og oppdager vanligvis flere arter.

Selskapet har i de siste to årene jobbet tett med ledende akademiske forskergrupper og miljøpolitiske beslutningstakere for å utvikle, teste og forfinne metodene. De har med hell jobbet med å overvåke fisk i Storbritannia og internasjonale farvann, inkludert innsjøer, elver og hav. I ett tilfelle avslørte bare 300 ml vann samlet fra Devonshire-kysten tilstedeværelsen av 25 forskjellige arter av fisk. I et annet tilfelle, i samarbeid med svenske firmaet AquaBiota, ble det oppdaget en narwhal i en prøve fra Arktis.

Selskapets grunnleggere inkluderer ledende forskere Prof Douglas Yu, fra UEAs Biovitenskapelige Skole, og prof Alfried Vogler, fra Imperial College London.

Prof Yu sa: "Vår teknologi betyr at klienter kan samle en enkel vannprøve og teste den for å se om den inneholder spor av DNA fra bestemte arter.

"Hver fisk kaster DNA, og til og med små fragmenter av det DNA kan brukes til å identifisere arter tilbake i laboratoriet, slik at fiskene selv ikke trenger å bli oppdaget.

"Denne prosessen er raskere, billigere og mer nøyaktig enn tradisjonelle metoder for overvåkning av biologisk mangfold." han la til.

Teknikken har applikasjoner for bedrifter, lokale myndigheter og bevaringsgrupper. Kat Bruce, medstifter og MD ved NatureMetrics, sa: "Metoden gjør det mulig for noen å gjennomføre en fiskeundersøkelse for å finne ut hvilke arter som finnes i området uten å fange eller forstyrre dem. Og vi oppdager ofte andre ikke-fiskearter på samtidig - vår eDNA bycatch har inkludert alt fra newts til narwhals.

"Vi er glade for å lansere den for å gi våre kunder bedre informasjon om arter og mangfold, og i sin tur bedre informere sine miljøledelsesbeslutninger."

I et av sine tidlige prosjekter jobbet NatureMetrics med Norfolk-basert konsultasjon Combined Ecology Ltd for å undersøke elvefisk i Sierra Leone. Analysering av vannprøver viste 54 arter av fisk, hvorav 60% kunne identifiseres for arter.

Dr Phil Atkinson fra Kombinert Økologi sa: "Vi er glade for å se dette komme i forkant etter måneder med innovasjon og hardt arbeid fra NatureMetrics-teamet, og er veldig glad for at kombinert økologi har vært en del av den reisen. Vi jobber ofte i fjerntliggende og utfordrende, men svært biologiske mangfoldige miljøer hvor denne skalaen og kvaliteten på informasjonen nettopp ikke har vært tilgjengelig før - eDNA vil være en spillveksler. "

Fiskemålingene bygger på Nature Metrics eksisterende DNA-basert overvåking, inkludert deteksjon av Great Crested Newts og andre amfibier, overvåking av dyrelivssykdommer, invasiv arterovervåking og storskala overvåkning av uvirvelløse samfunn som kan bidra til å gi kraftige data om økosystemet Helse.

menu
menu